Dieses Klappern bei geöffnetem Verdeck hab ich auch. Ich habe testweise die Arretierung/den Haken bei offener Fahrt geschlossen (Arretierung schließen und dann das Verdeck hinter den Sitzen einrasten), das scheint aber auch nicht zu helfen. Das Windschott scheint auch nicht schuld zu sein. Das Geräusch rührt offenbar von irgendwo oberhalb des/hinter dem Mittelfach(s) her.
Genau dieses Klappern habe ich auch.