Du kannst wenn eine navi-ansage kommt einfach währenddessen die Lautstärke auf 0 drehen, das bezieht sich dann nur aufs Navi.
Gleiches sollte andersrum gehen.
Alternativ geht das auch bestimmt übers Menü, in Ermangelung eines mx5 kann ich das aber nicht sagen.
Wenn die Naviansagen auf 0 gestellt sind kann man die Lautstärkeb nur noch übers Menü wieder hocholen.
Während der Anssage den Mute-Knopf zu drücken sollte das Radio und nicht das Navi stumm schalten, müsste ich aber auch ausprobieren, geht aber in Ermangelung meines MX5 gerade nicht 
Zumindest kann man Naviansagen und Radiolautstärke unabhängig voneinander regeln, der Mute Knopf bezieht sich (soweit ich weiss) auf sämtliche Ansagen.
Guck einfach mal zb im Navi ganz rechts in die Einstellungen.